关于两者的关系，我国财政部财政科学研究所的高绍华先生归纳了三点，很具代表性。
首先他认为一个企业有三条供应链，即物资供应链、资金供应链和信息供应链，ERP系统就是对企业的物流、资金流和信息流实施优化管理。而电子商务主要涉及到的是采购与销售业务，实质是网上电子采购和网上电子销售，它们只是使企业原有物流和资金流分别增加了一个入口和出口，并成为新物流与资金流的一部分而已。这就是说，通过重组企业组织结构及业务流程，电子商务可以融入企业的供应链中。只不过对于网上模式，客户的订单、企业的采购单要由网上形成和交付，货币收支亦由网上进行。
其次他认为，从上面的分析我们得知，ERP 系统作用于企业的整个业务流程，其应用层次分为三层：决策层的数据查询与综合分析、中间层的管理与控制、作业层的业务实现。而电子商务主要在于作业层的业务实现，具体来讲，是采购和销售业务的网上实现，也包括为市场营销提供网上辅助手段，例如，网上产品发布、网上商机搜索、诚信认证、即时通讯等。
最后他认为，根据我国企业目前的内外部条件，企业在引进电子商务时，不会完全摒弃传统的采购与销售模式，单单使用网上模式，而是两种模式、两个系统会共同存在，互为补充。当然，在今后，网上模式会越来越占优势。
因此高绍华说：“由于电子商务与ERP之间存在着种种密切的联系，我们不能再把它们简单地看作是独立的两个对象，而是应该用联系的观点去认识和研究它们。”
于是，有别于综合和行业这两类B2B网站，我国在B2B领域开始出现新生力量的身影。用友的移动商街、金蝶的友商网、金算盘的亿禧网、神州数码在线、速达亿商客……B2B新生力量呈齐步走之势，雏声开始响起。
ERP长出的“电子尾巴”
有理论说，ERP厂商向电子商务扩展属于典型的“长尾现象”。从上面那些管理专家的分析中就可以明显看出，由于电子商务与ERP有着那样密切的关系，拥有IT技术优势的管理软件厂商们向电子商务领域扩展实际上是一个迟早的事。
那么ERP厂商长出来的这一“长尾”与传统电子商务网站有什么不一样呢?
ERP厂商认为，传统电子商务网站主要是一个“电子集市”，它帮助企业发布信息与搜索商机，起到撮合生意之作用。他们认为，其最大的弱点就是没有管理功能，大致讲来它只管理了“交易中”这一环节。
在管理软件领域积累了丰富经验的ERP厂商，也许正是看到了传统电子商务的局限性，开始想像充分发挥自身IT技术优势，如何将两者融合，使内外数据信息共享，将企业的内部管理系统成功延展到了整个外部供应链的管理。国内在这上面先有实际行动的金算盘老总杨春(其2006年7月推出全程电子商务平台)就认为，这样的B2B网站除了传统B2B的功能之外，还多了一个无缝结合的管理后台——在线软件，因此可以实现企业交易前中后全过程的管理，并且可以迁移到移动通讯网等上去“移动应用”。
ERP厂商认为，让B2B新生力量引以为傲的资本应该是，通过管理功能，这样的平台还可以帮助企业建立自己的基于其上下游的供应链，从而参与全球供应链竞争。在当今竞争已经从单体发展成为供应链与供应链之间的竞争时，并宣称这一特性尤其珍贵。
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